स्वतंत्रता के समय, पटेल 72 थे। शाही रियासतों को जोड़ने और उनके एकीकरण का कार्यभार संभालने से पहले, उनका स्वास्थ्य बिगड़ना शुरू हो गया था और उन्हें पूरी तरह आराम करने की सलाह दी गई थी। फिर भी, स्वतंत्र भारत की पहली कैबिनेट के सदस्य के रूप में, उन्होंने तत्काल तीन मंत्रालयों - गृह, राज्य और सूचना का प्रभार संभाला।इसके अतिरिक्त, वह भारत के उप प्रधान मंत्री भी थे। इस अवधि के दौरान, जब भी नेहरू विदेश यात्रा करते थे, पटेल ने कार्यवाहक प्रधान मंत्री होने की जिम्मेदारी भी सँभाली। जब राज्य विभाग के सचिव, वी.पी. मेनन ने आज़ादी के समय पटेल को बताया कि स्वतंत्रता का सपना हासिल करने के बाद वे शायद सेवा -निवृत्त होना पसंद करते, पटेल ने उनसे कहा कि यह कोई विश्राम करने या सेवा -निवृत्त होने का समय नहीं है क्योंकि युवा राष्ट्र को उनकी सेवाओं की जरूरत है। पटेल ने भी एक मजबूत स्वतंत्र भारत के निर्माण की चुनौती का सामना करने के लिए बढ़ती उम्र और गिरते स्वास्थ्य की चिंताओं को एक किनारे कर दिया।

मंत्री के रूप में इन जिम्मेदारियों के अलावा, पटेल संविधान सभा के सदस्य भी थे जो नवजात राष्ट्र के लिए संविधान का एक प्रारूप तैयार कर रही थी। इस संबंध में, वे विधानसभा की अल्पसंख्यक उप-समिति के अध्यक्ष थे और भारत के विभिन्न लोगों के बीच मौजूद कई मतभेदों को समाप्त करने के लिए वे चिंतित थे और सभी भारतीयों के एक समुदाय के रूप में एकजुट हो जाने की कोशिश में थे।

राज्य विभाग के प्रभारी मंत्री के रूप में, पटेल ने 565 रियासतों को एक साथ लाने और उनके प्रशासन को एकीकृत करने, भारत में अपनी सेना और प्रणालियों को एकीकृत करने के महत्वपूर्ण कार्य को अंजाम दिया। उन्होंने राजाओं और नवाबों से मिलने के लिए बड़े पैमाने पर यात्रा की, बातचीत के लिए दर्जनों बैठकों का आयोजन किया और सैकड़ों पत्र लिखे। जयपुर की इस तरह की यात्रा में, उनका विमान दुर्घटना-ग्रस्त हो गया और पटेल मरते-मरते बचे।

जनवरी 1948 में अपने गुरु और मार्गदर्शक गांधी की मृत्यु से पटेल को एक गहरा झटका लगा। मार्च 1 9 48 में उन्हें हृदय का दौरा पड़ा। जल्दी ही चेतना लौटने के पर पटेल ने कहा, 'मैं बापू के पास जा रहा था। तुमने मुझे क्यों रोक दिया? ' जो गांधी के प्रति उनके गहरे लगाव को दर्शाता है। इसके बाद, वे यह कहते हुए सुने जाते कि 'ठीक है, मैं जानता हूँ कि बापू के पास जाने के लिए अंतिम पुकार आ रही है, लेकिन जब तक मैं कर सकता हूँ, मुझे देश के लिए काम करना होगा। नवंबर    1950 में पटेल आंतों के विकार और उच्च रक्तचाप से गंभीर रूप से बीमार हो गए। उन्हें आगे के इलाज के लिए मुंबई लाया गया जहां उनकी बेटी मनीबेन ने बड़ी निष्ठा के साथ उनका ध्यान रखा। लेकिन उन्हें एक हृदयाघात हुआ और 15 दिसंबर, 1950 को एकदम तड़के, भारत के लौह-पुरुष ने अंतिम बार अपनी आँखें मूँद लीं। भारत के राष्ट्रपति राजेंद्र प्रसाद, प्रधान मंत्री जवाहरलाल नेहरू और कई अन्य नेता पटेल के अंतिम संस्कार के लिए बंबई गए, जहां भारत के सबसे बड़े नेताओं में से एक को श्रद्धांजलि देने के लिए छह मील लंबा जुलूस इंतजार कर रहा था। अंतिम संस्कार पटेल के बेटे दयाभाई द्वारा बॉम्बे में क्वींस रोड के शवदाह गृह में  किया गया।

'वल्लभभाई क्या प्रेरणा, साहस, आत्मविश्वास और शक्ति अवतार थे! हम उनके जैसा फिर कभीनहीं देख पाएंगे।' सी. राजगोपालाचारी ने भारत के लौह पुरुष को एकदम उपयुक्त श्रद्धांजलि दी। मौलाना आज़ाद ने पटेल के वीरता को पहाड़ों की तरह उच्च और उनकी दृढ़ता को इस्पात की तरह मजबूत बताया।

'इतिहास' नेहरू ने सरदार के बारे में कहा, 'उन्हें नए भारत का निर्माता और संगठनकर्ता कहेगा'।